GENONE
Vá Além dos Dogmas
O princípio central da biologia molecular, de Francis Crick em 1958, diz que o DNA serve como molde para a síntese de RNA, que por sua vez, orienta a produção de proteínas. Nas últimas décadas muito foi detalhado sobre os papéis cruciais do RNA mensageiro, de transferência e ribossômico no processo de síntese proteica.
No entanto, também foi descoberto que o RNA não se limita apenas à construção de proteínas; ele desempenha uma variedade de funções celulares, algumas das quais tradicionalmente atribuídas ao DNA e às proteínas.
Muitos pesquisadores já contam com a GenOne para compreender como o RNA pode transportar informações genéticas, agir como catalisador de reações bioquímicas e modular a produção de proteínas através de estudos de sequenciamento de RNA.
Explore também como os avanços do sequenciamento de nova geração vem impulsionando a transcriptômica, contribuindo para diagnósticos, tratamentos de doenças e desenvolvimento de novos produtos.
mRNA-seq
Sequenciamento de RNA mensageiro com seleção por cauda poli-A em plataforma Illumina. Permite analisar expressão gênica, identificar genes diferencialmente expressos e investigar vias biológicas relacionadas a processos celulares ou condições experimentais.
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 20M-40M reads
lncRNA-seq
Sequenciamento de RNAs longos não codificadores (lncRNAs) a partir de bibliotecas direcionais com depleção de rRNA em plataforma Illumina. Permite investigar o papel regulatório dos lncRNAs na expressão gênica e em processos biológicos complexos.
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 30M-50M reads
smallRNA-seq
Sequenciamento de pequenos RNAs (sRNAs), como miRNAs, siRNAs e piRNAs, com preparo de biblioteca por seleção de tamanho e leitura Illumina SE50. Utilizado para análise da regulação pós-transcricional e respostas celulares a estímulos fisiológicos ou ambientais.
- Plataforma: Illumina SE50
- Leitura Recomendada: 10M-20M reads
circRNA-seq
Sequenciamento de RNAs circulares (circRNAs) com preparo de bibliotecas depletadas de rRNA em plataforma Illumina. Permite investigar o papel dos circRNAs na regulação pós-transcricional, expressão gênica e redes de RNAs endógenos competitivos (ceRNA), incluindo a detecção paralela de lncRNAs e mRNAs
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 50M-70M reads
RNA-seq Total
Sequenciamento abrangente de RNA total, incluindo mRNA, lncRNA e circRNA, com análise bioinformática completa para explorar a expressão gênica e a regulação do transcriptoma.
Utiliza depleção de rRNA seguida do preparo de bibliotecas PE150 e SE50 com seleção de tamanho, adaptando a estratégia ao perfil dos RNAs de interesse.
- Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
- Leitura Recomendada: 60M reads
- Plataforma: Illumina SE50
- Leitura Recomendada: 10M-20M reads
RNA-seq Procariótico
Sequenciamento de mRNA procariótico com bibliotecas direcionais depletadas de rRNA em plataforma Illumina.
Inclui análise bioinformática completa do transcriptoma: expressão gênica, genes diferencialmente expressos (DEGs), estrutura dos transcritos e identificação de sRNAs, com base no alinhamento ao genoma de referência.
- Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
- Leitura Recomendada: 10M reads
mRNA-seq full-length
Sequenciamento de transcritos completos com tecnologias de leitura longa, como Nanopore ou PacBio, sem fragmentação do RNA.
Permite identificar isoformas, splicing alternativo, variantes de transcrição e a estrutura integral dos mRNAs, com alta fidelidade na análise do transcriptoma.
- Plataforma: PacBio Revio
- Leitura Recomendada: 5/10 M CCS
- Plataforma: Nanopore PromethION 48
- Leitura Recomendada: 6/12 Gb
mRNA-seq full-length 2+3
Combinação estratégica de PacBio (Iso-Seq) e Illumina para caracterização e quantificação de isoformas de mRNA. PacBio permite o sequenciamento de transcritos completos com alta acurácia (HiFi reads), revelando splicing alternativo, fusões gênicas e eventos de poliadenilação. Illumina complementa com a quantificação precisa das isoformas identificadas.
- Plataforma: PacBio Revio
- Leitura Recomendada: 5/10M CCS
- Plataforma: Illumina NovaSeq
- Leitura Recomendada: 6-10Gb
smallRNA-seq exosomal
Sequenciamento de pequenos RNAs presentes em exossomos isolados, com foco em miRNAs, utilizando tecnologia Illumina.
Permite investigar mecanismos de silenciamento pós-transcricional mediados por miRNAs, como miR-126 e miR-92a, que regulam a expressão gênica em células-alvo e participam de processos como angiogênese tumoral.
- Plataforma: Illumina SE50
- Leitura Recomendada: 10-20M reads
Análises Bioinformáticas em Transcriptômica
A GenOne oferece uma solução completa em bioinformática para projetos de transcriptômica, abrangendo diferentes classes de RNA — mRNA, lncRNA, miRNA, circRNA e RNA total — com dados gerados por tecnologias de leitura curta (Illumina) e longa (Nanopore ou PacBio).
Nossas análises incluem:
Quantificação e expressão diferencial de transcritos, com relatórios visuais e estatísticos que destacam genes regulados em diferentes condições;
Análise de isoformas e splicing alternativo, com identificação de variantes de transcrição e estrutura completa dos mRNAs;
Coexpressão e integração de dados multi-RNA, permitindo correlações entre mRNAs, lncRNAs, miRNAs e circRNAs;
Construção de redes ceRNA (competing endogenous RNA), conectando transcritos reguladores e suas interações funcionais;
Mapeamento funcional de genes com análise de enriquecimento em vias metabólicas (KEGG), funções biológicas (GO) e redes proteína-proteína;
Predição de alvos e análise de conservação, essenciais para a compreensão funcional de miRNAs e lncRNAs;
Análises especializadas para RNA exossomal, com foco em miRNAs e sua atuação na comunicação intercelular;
Visualizações avançadas, como PCA, volcano plots, heatmaps e redes de interação, com entrega clara e publicável.
Cada projeto é tratado com rigor analítico e adaptação às particularidades da amostra, da plataforma e dos objetivos biológicos, garantindo resultados profundos e confiáveis.
Parâmetros de Amostras
Ácidos Nucleicos Purificados
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,75
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,6
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
Eucarioto: ≥ 20
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Procarioto: ≥ 50
≥ 1
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,0;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 100
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,75
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,6
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
Eucarioto: ≥ 20
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Procarioto: ≥ 50
≥ 1
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,0;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 100
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Entrega padrão
Os resultados são entregues sempre com relatórios de controle de qualidade
via compartilhamento em nuvem, com backup garantido por pelo menos 90 dias.
Distribuição Gnômica
Alinahmento com Genoma de Referência
Expressão Gênica
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