Proteômica
Além dos serviços de Genômica avançados oferecidos pela GenOne, também oferecemos serviços de análise de proteínas. Juntas, Genômica, Transcriptômica e Proteômica, permitem um alto nível de compreensão dos sistemas biológicos.
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Perfil Proteômico
- Casos:
- The Oyster Genome Reveals Stress Adaptation and Complexity of Shell Formation. Nature. 490, 49–54 (2012).
- In-depth Proteome Analysis of The Rubber Particle of Hevea Brasiliensis (Para Rubber Tree). Plant Mol Biol. 82(1-2):155-68 (2013).
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Proteômica Quantitativa – iTRAQ.
A tecnologia iTRAQ (isobaric tag for relative and absolute quantitation), é uma técnica não baseada em eletroforese em gel que é utilizada para quantificar proteínas de diferentes fontes de uma única vez. O método baseia-se na marcação covalente da porção N-terminal e das aminas de cadeia lateral de peptideos a partir da digestões de proteínas com tags de massa variável.
A tecnologia iTRAQ (isobaric tag for relative and absolute quantitation), é uma técnica não baseada em eletroforese em gel que é utilizada para quantificar proteínas de diferentes fontes de uma única vez. O método baseia-se na marcação covalente da porção N-terminal e das aminas de cadeia lateral de peptideos a partir da digestões de proteínas com tags de massa variável.
O iTRAQ_8-plex_kit que nós fornecemos podem ser usados para marcar todos os péptidos de diferentes amostras/tratamentos. Estas amostras são então reunidas e geralmente fraccionadas por nano cromatografia líquida, seguido de análise por espectrometria de massa em tandem (MS/MS). Uma busca em bancos de dados é então realizada utilizando os dados da fragmentação para identificar os peptidos marcados e, consequentemente, as proteínas correspondentes. A fragmentação do tag gera uma baixa massa molecular de íons repórters que podem ser utilizada para quantificar relativamente os peptideos e as proteínas que lhes deram origem.
O iTRAQ_8-plex_kit que nós fornecemos podem ser usados para marcar todos os péptidos de diferentes amostras/tratamentos. Estas amostras são então reunidas e geralmente fraccionadas por nano cromatografia líquida, seguido de análise por espectrometria de massa em tandem (MS/MS). Uma busca em bancos de dados é então realizada utilizando os dados da fragmentação para identificar os peptidos marcados e, consequentemente, as proteínas correspondentes. A fragmentação do tag gera uma baixa massa molecular de íons repórters que podem ser utilizada para quantificar relativamente os peptideos e as proteínas que lhes deram origem.
- Casos:
- Identification of Novel Biomarkers for Sepsis Prognosis via Urinary Proteomic Analysis Using iTRAQ Labeling and 2D-LC-MS/MS. Plos one. DOI: 10.1371/journal.pone.0054237 (2013).
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Proteômica Quantitativa – Label-Free
- Casos:
- Comparative Analysis of Dynamic Proteomic Profiles between in Vivo and in Vitro Produced Mouse Embryos during Postimplantation Period. J. Proteome Res. 12 (9), 3843–3856 (2013).
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Identificação de Proteínas
- Serviços:
- Identificação de proteínas em spots/bandas de géis.
- Identificação de proteínas de bandas visíveis ou spots obtidas de géis corados com Coomassie ou ou com prata.
- Identificação de proteínas em spots/bandas de géis.
- Verificação de produtos de expressão de proteínas.
- A detecção de proteínas co-preciptadas em testes de imunoprecipitação.
Bandas – LC-MS/MS
Spots – MALDI-TOF/TOF
Peso Molecular
- Casos:
- Proteomics Study of Rice Embryogenesis: Discovery of The Embryogenesis-dependent Globulins. Electrophoresis. 33(7):1129-38 (2012).
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