GENONE
Vá Além dos Dogmas
O princípio central da biologia molecular, de Francis Crick em 1958, diz que o DNA serve como molde para a síntese de RNA, que por sua vez, orienta a produção de proteínas. Nas últimas décadas muito foi detalhado sobre os papéis cruciais do RNA mensageiro, de transferência e ribossômico no processo de síntese proteica.
No entanto, também foi descoberto que o RNA não se limita apenas à construção de proteínas; ele desempenha uma variedade de funções celulares, algumas das quais tradicionalmente atribuídas ao DNA e às proteínas.
Muitos pesquisadores já contam com a GenOne para compreender como o RNA pode transportar informações genéticas, agir como catalisador de reações bioquímicas e modular a produção de proteínas através de estudos de sequenciamento de RNA.
Explore também como os avanços do sequenciamento de nova geração vem impulsionando a transcriptômica, contribuindo para diagnósticos, tratamentos de doenças e desenvolvimento de novos produtos.
mRNA-seq
Estudo do RNA mensageiro através do preparo de bibliotecas de captura poli-A e sequenciamento em plataforma Illumina.
Útil para determinar o perfil de expressão gênica, genes diferencialmente expressos e vias funcionais envolvidas em um dado fenômeno biológico.
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 20M-40M reads
- Bibliotecas: simples, direcional, depleção rRNA e depleção de Globinas.
lncRNA-seq
Análise focada em RNAs longos não codificadores (lncRNAs) realizada através do sequenciamento de bibliotecas direcionais depletadas de rRNA em plataforma Illumina, onde é possível entender seu papel na regulação gênica e em processos biológicos.
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 30M-50M reads
smallRNA-seq
Identificação e quantificação de pequenos RNA (sRNAs), como miRNAs, siRNAs e piRNAs, via preparo de biblioteca com seleção de tamanho e sequenciamento Illumina SE50, utilizado para oferecer insights sobre regulação gênica e respostas a estímulos.
- Plataforma: Illumina SE50
- Leitura Recomendada: 10M-20M reads
circRNA-seq
Sequenciamento para identificar e quantificar RNA circulares (circRNAs), revelando sua influência na regulação pós-transcricional e na expressão gênica.
Preparamos as bibliotecas com depleção de rRNA, permitindo analisar não somente circRNAs, mas também lncRNAs, mRNAs e a rede de RNAs endógenos competitivos (ceRNA).
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 50M-70M reads
RNA-seq Total
Sequenciamento completo de todo o RNA presente, incluindo mRNA, lncRNA e circRNA, com bioinfrmática abrangente para uma visão global da expressão gênica e regulação transcriptômica.
Abordagem via depleção de rRNA seguida de preparação de biblioteca PE150 e seleção de tamanho seguida de preparação de biblioteca SE50.
- Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
- Leitura Recomendada: 60M reads
- Plataforma: Illumina PE150
- Leitura Recomendada: 10M-20M reads
RNA-seq Procariótico
Análise focada em mRNA procariótico via sequenciamento de bibliotecas direcionais depletadas de rRNA em plataforma Illumina.
Análise bioinformática completa do transcriptoma, incluindo expressão gênica, DEGs, estrutura do transcrito e sRNAs, através do alinhamento a um genoma de referência.
- Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
- Leitura Recomendada: 10M reads
Parâmetros de Amostras
Ácidos Nucleicos Purificados
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,75
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,6
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
Eucarioto: ≥ 20
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Procarioto: ≥ 50
≥ 1
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,0;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 100
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,75
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥100
≥ 0,6
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥7,0;
Para animais: RIN≥7,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
Eucarioto: ≥ 20
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Procarioto: ≥ 50
≥ 1
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,0;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 80
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Concentração e Pureza
Qubit Conc. (ng/μL)
Quantidade (μg)
OD260/280
OD260/230
≥ 100
≥ 0,5
1,7-2,5
0,5-2,5
Integridade
Para plantas: RIN≥6,5;
Para animais: RIN≥6,5;
5,0≥28S/18S≥1,0;
Entrega padrão
Os resultados são entregues sempre com relatórios de controle de qualidade
via compartilhamento em nuvem, com backup garantido por pelo menos 90 dias.
Distribuição Gnômica
Alinahmento com Genoma de Referência
Expressão Gênica
Explore Genes Diferencialmente Expressos
Avaliação Estrutural
Estudo de Splicing Alternativos e Novos Transcritos
Estudo Funcional
Análise de Vias Metabólicas e de Sinalização
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